El Fondo de Desarrollo del Transporte Terrestre (FONDET) fue creado para ser operado por dos instancias, un Consejo Directivo y una Dirección Ejecutiva. Las funciones del Consejo son legislativas y reguladoras, las de la Dirección son Administrativas.

Tal y como lo establecen los decretos 250-07 y 583-07 “Art. 3: El Consejo Directivo del Fondo de Desarrollo del Transporte Terrestre estará integrado como sigue:

1. Un presidente designado por el Poder Ejecutivo.
2. Los funcionarios encargados de la Oficina para el Reordenamiento del Transporte (OPRET), la Autoridad Metropolitana de Transporte (AMET), la Oficina Técnica de Transporte Terrestre (OTTT), la Contraloría General de la República y el Secretario de Obras Públicas y Comunicaciones.
3. Un representante por cada una de las siguientes centrales y/o confederaciones de transporte: Confederación Nacional de Transporte (CONATRA), Federación Nacional de Transporte la Nueva Opción (FENATRANO), Federación Nacional de Transporte Dominicano (FENATRADO), Central Nacional de Transportistas Unificados (CNTU), Movimiento Choferil del Transporte (MOCHOTRAN) y Unión Nacional de Transportistas y Afines (UNATRAFIN).
4. Dos miembros designados por el Poder Ejecutivo.
5. Un Director Ejecutivo designado por el Poder Ejecutivo, quien asistirá al consejo como secretario con voz y sin voto.

Los integrantes originales del Consejo Directivo son: Ing. Milciades Pérez Polanco, Presidente, y como miembros los Encargados de la Dirección de: AMET, OTTT, OPRET, Contraloría General de la República, así como un representante por cada una de las siguientes Federaciones de Transporte: CONATRA, FENATRADO y FENATRANO, además, como Secretario del Consejo, el Director Ejecutivo del FONDET.

Luego fueron designados mediante el decreto 583-07 los señores Ramón Pérez Figuereo, Alfredo Pulinario Linares (Cambita) y Anastasio González así como el Lic. Ángel Lockward en representación del Poder Ejecutivo.